Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms