Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms