Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DPCDQ9BVM2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms