Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRDL1Q9BU40 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms