Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDC1Q9BTX1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms