Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF1Q9BSM1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms