Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TINF2Q9BSI4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms