Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SGIP1Q9BQI5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SGIP1Q9BQI5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms