Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINFPQ9BQA5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms