Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNS3Q9BQ31 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms