Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP1Q9BPW8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms