Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3AQ99856 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms