Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARXQ96QS3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms