Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCLT1Q96NL6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms