Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC43Q96MW1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms