Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms