Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms