Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms