Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGBD1Q96JS3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms