Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LRRIQ1Q96JM4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRIQ1Q96JM4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
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