Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms