Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms