Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC59Q96AG4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC59Q96AG4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms