Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX21Q969T3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms