Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms