Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HPS3Q969F9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms