Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms