Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRG4Q92954 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PRG4Q92954 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms