Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGGTAQ92696 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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