Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms