Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCAF4Q8WV16 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF4Q8WV16 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms