Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

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Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC7Q8WUI4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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HDAC7Q8WUI4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC7Q8WUI4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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