Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms