Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FAT3Q8TDW7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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