Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms