Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIEQ8NEW7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms