Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00116Q8NCU8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms