Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms