Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms