Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms