Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNBD1Q8NA66 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms