Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms