Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms