Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z2

ABRA, Actin-binding Rho-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAQ8N0Z2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAQ8N0Z2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms