Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms