Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC4Q7Z404 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC4Q7Z404 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms