Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT25Q7Z3Z0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms