Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRCQ7RTU9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms