Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms