Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM43Q6ZSC3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms